Metodický pokyn CHJ č. 17 nabízí pomoc všem auditorům při přezkoumávání funkčnosti a přiměřenosti vnitřního kontrolního systému v orgánu veřejné správy. Je určen primárně pro auditory zařazené v útvarech interního auditu orgánu veřejné správy nebo samostatné interní auditory, kteří byli pověřeni výkonem interního auditu u orgánu veřejné správy. Své využití najde tato metodická příručka také u kontrolorů vykonávajících veřejnosprávní kontrolu se zaměřením na vnitřní kontrolní systém, kontrolorů vykonávajících různé formy vnitřní kontroly nebo vedoucích orgánu veřejné správy, kteří berou svou odpovědnost za zavedení a fungování vnitřního kontrolního systému v plné vážnosti a podílejí se na revizích jeho fungování.

Vnitřní kontrolní systém je souhrn všech nástrojů, procesů, postupů a opatření, které jsou zavedeny v orgánu veřejné správy k ošetření rizik, která ohrožují dosahování cílů a plnění úkolů orgánu veřejné správy. Funkční a přiměřený vnitřní kontrolní systém orgánu veřejné správy je základním předpokladem pro zajištění ochrany veřejných prostředků. Přestože je audit vnitřního kontrolního systému nelehkým úkolem, neměl by v plánech interních auditorů s přihlédnutí k aktuálnosti jeho potřeby chybět. V tomto metodickém pokynu naleznete stručný teoretický základ, na který navazuje popis optimálního stavu auditované oblasti. Klíčové je stanovení základních otázek, které by si měl každý interní auditor klást při provádění auditu vnitřního kontrolního systému.

Interní audit i požadavky na tvorbu a udržování přiměřeného a účinného vnitřního kontrolního systému v orgánech veřejné správy jsou upraveny zákonem č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě, který je účinný do 31. prosince 2026 a jeho prováděcí vyhláškou č. 416/2004 Sb. Verze 1.0 metodického pokynu je v souladu s požadavky zákona č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě. Verze 1.0 nereflektuje požadavky nadcházející právní úpravy účinné od 1. ledna 2027.

S účinností od 1. ledna 2027 je zákon č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě nahrazen zákonem č. 231/2025 Sb., o řízení a kontrole ve veřejných financí. Aktualizovaná verze 2.0 metodického pokynu reflektuje požadavky zákona č. 231/2025 Sb., o řízení a kontrole veřejných financí.